2020/114 Servei de seqüenciació (Next Generation Sequencing) per tal d'obtenir un genoma complert de varies especies de planàries d'aigua dolça pel Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística de la Universitat de Barcelona

L'objecte d'aquest contracte és el servei de seqüenciació (Next Generation Sequencing) per tal d'obtenir un genoma complert de varies especies de planàries d'aigua dolça pel Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística de la Universitat de Barcelona. Aquest servei consisteix en la realització de seqüència complerta del genoma de 3 espècies de planàries d'aigües dolces (Platyhelminthes) a alta cobertura i a nivell cromosòmic, mitjançant la metodologia PacBio Seqel II, i l'obtenció de llibreries de proximitat Omni-C i el seu posterior assemblatge amb un software específic (HiRise). L'objecte també inclou:-\tcontrol de qualitat de la mostra amb una alta cobertura i continuïtat a ser possible a nivell cromosòmic;-\temprar metodologies per seqüenciar fragments llargs;-\tpreparació de llibreries de proximitat que permeten inferir els fragments propers al genoma; i-\tutilitzar un software especialitzat que permet analitzar els dos tipus d'informació simultàniament i obtenir un assemblatge del genoma d'alta qualitat.Aquesta contractació s'inclou dins l'execució del projecte de recerca Comprendiendo los procesos que generan diversidad genética en la naturaleza: Estrategias reproductoras, actividad humana y cambios climaticos amb número de referència PGC2018-093924-B-I00 MICIU/AEI/FEDER/UE (Convocatoria 2018 de proyectos de I+DDE «Generación de conocimiento», del programa estatal de generación de conocimiento y fortalecimiento científico y tecnológico del sistema de I+D, en el marco del plan estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2017-2020). IP Marta Riutort León.