F26.058CN - SERVEIS DE CONSTRUCCIÓ DE LLIBRERIES I SEQÜENCIACIÓ DIRECTA D’RNA MITJANÇANT TECNOLOGIA NANOPORE PEL PROJECTE A-20621 DE LA FRCB-IDIBAPS

Requisito técnico

Relació serveis o treballs efectuats de la mateixa naturalesa en el curs de com a màxim els últims tres anys: - Els licitadors hauran d'acreditar que durant els darrers tres (3) anys han executat, com a mínim, dos (2) serveis complets de preparació de llibreries i seqüenciació directa d'RNA (Direct RNA Sequencing) mitjançant tecnologia Oxford Nanopore Technologies (ONT). - Els serveis acreditats hauran d'haver comportat, en conjunt, el processament d'un mínim de 30 mostres de Direct RNA Sequencing amb tecnologia ONT. Cada servei haurà d'incloure, com a mínim: a) Preparació de llibreries • Preparació completa de llibreries per a Direct RNA Sequencing (dRNA-seq) a partir d'RNA poliA, d'acord amb els protocols oficials d'Oxford Nanopore Technologies. • S'acceptarà experiència acreditada tant en plataformes GridION com PromethION, atès que utilitzen la mateixa tecnologia de seqüenciació i els mateixos protocols experimentals. b) Processament i control de qualitat de mostres d'RNA • Quantificació fluorimètrica. • Avaluació de la integritat de l'RNA mitjançant RIN/RQN, DV200 o paràmetres equivalents. c) Seqüenciació i obtenció de dades • Preparació de llibreries llestes per a la seva càrrega en plataformes Oxford Nanopore Technologies compatibles. • Execució completa del procés de seqüenciació i generació de les dades corresponents. • Aplicació de totes les fases del flux experimental requerit per la metodologia de Direct RNA Sequencing. Requisit econòmic mínim: Cadascun dels serveis acreditats haurà de tenir un import mínim de 5.000 euros (IVA exclòs).

Requisito técnico

Maquinària, material i l’equip tècnic a disposició: Maquinaria mínima: • Disposar de l’equip Promethion 24 o 48 d’Oxford Nanoper Technology • Programari MinKNOW i eines ONT actualitzades. • Equipament de QC: fluorímetre, bioanalitzador o equivalent. • Sistemes d'emmagatzematge segur d'alta capacitat (≥ 50 TB).

Requisito técnico

Personal tècnic o unitats tècniques: a) Responsable tècnic/a del servei: Requisits mínims: • Titulació universitària en ciències (Biologia, Bioquímica, Biotecnologia, Genètica o titulacions equivalents). • Experiència mínima de 3 anys en maneig i preparació de mostres per a seqüenciació long-read o RNA-seq. • Experiència acreditada en tecnologia Oxford Nanopore Technologies (ONT). • Haver participat, durant els darrers tres (3) anys, en projectes de Direct RNA Sequencing amb tecnologia ONT que hagin comportat el processament d'un mínim de 10 mostres. b) Tècnic/a de laboratori amb experiència en ONT Requisits mínims: - Formació específica en tècniques de laboratori biològic, equivalent com a mínim a un Cicle Formatiu de Grau Superior en Laboratori Clínic i Biomèdic o titulació similar. - Experiència mínima d'1 any en els últims 3 anys en tasques de: • preparació de llibreries ONT (Direct RNA, Direct cDNA, Whole Transcriptome), • maneig de fluxos PromethION, • control de qualitat previ i posterior a la seqüenciació.

Requisito técnico

Instal·lacions tècniques: • Disposar d’un laboratori adequadament equipat per a la preparació de llibreries, manipulació de material biològic i seqüenciació d’ARN d’alta complexitat, amb instruments idonis per al control de qualitat, la quantificació i l’anàlisi molecular de mostres d’RNA. • El laboratori on es realitzin les activitats de preparació de mostres, control de qualitat i seqüenciació directa d’RNA (Direct RNA Sequencing) mitjançant tecnologia Oxford Nanopore Technologies (PromethION) haurà de disposar d’una acreditació vigent conforme a la norma ISO/IEC 17025:2017, o d’un sistema de qualitat equivalent que acrediti competència tècnica en anàlisi molecular, processos d’assaig o validació de mètodes. La norma o sistema aportat haurà de garantir, com a mínim: o traçabilitat completa de mostres i reactius, o calibratge i manteniment de l’equipament científic, o aplicació de procediments normalitzats de treball (SOP), o registre i control de qualitat analítica en totes les fases del procés.

Requisito financiero

Volum anual de negocis: El volum anual de negocis de l'empresa licitadora haurà de ser, com a mínim, de 120.000,00 euros.

Requisito financiero

Assegurança de responsabilitat civil per riscos professionals: Import igual o superior a 200.000 euros.